2013年7月16日、日産はGT-Rの特別仕様車「GT-R スペシャルエディション（GT-R Special edition）」を発売した。
世界限定100台の限定車となり、専用ボディカラーなどが採用されている。

GT-R スペシャルエディション発売

ミッドナイトオパールを採用

「GT-R スペシャルエディション」はGT-R プレミアムエディションをベースに特別装備を追加。

ボディカラーは光の当たり方によって宝石のオパールのように色合いが変化する専用色ミッドナイトオパールを採用。
美しさを追求し、手作業で塗装を磨く工程を追加している。
他にもカーボン製リアスポイラーやチタンカラーのレイズ製アルミホイールを装備している。

また、エンジンルーム内に装着されるモデルナンバープレートもゴールドとなり、限定車ならではの特別感を演出。
安全面でも、カーテンエアバッグとサイドエアバッグを装備する。

日本国内での価格は消費税込み1,050万円となっている。